Лекция 6. Транскрипция
|
Лекция 6. Транскрипция |
|
| Список рисунков |
Этапы транскрипции
1. Узнавание и прочное связывание
Как только произошло узнавание (позиция 1), РНК-полимераза перемещается
в позицию 2. В каталитическом центре инициации транскрипции, находящемся в 
-субъединице,
оказывается +1-ый нуклеотид оперона. Переход из позиции 1 в позицию 2 возможен,
если на операторе нет белка-репрессора.
Примерно 5% промоторов у прокариот имеют только участок "-10", однако, тем не менее, хорошо узнаются РНК-полимеразой. Такие промоторы представлены палиндромными последовательностями, принимающими форму креста при суперспирализации кольцевых молекул ДНК.
Определение: палиндромы - последовательности, которые читаются одинаково слева направо и справа налево.
Палиндромы первого порядка имеют одну ось симметрии, второго - две, третьего - три.
2. Инициация заключается в образовании первой
фосфодиэфирной связи между пурин-трифосфатом (АТФ или ГТФ) и следующим нуклеотидом.
После инициации 
-
фактор покидает фермент.
3. Элонгация - последовательное наращивание цепи РНК (или продолжение транскрипции).
Скорость элонгации 40-50 нукл./сек.
Для комплементарного синтеза РНК необходим разрыв водородных связей в ДНК. Core-фермент РНК- полимеразы покрывает примерно 40 пар нуклеотидов (4 витка спирали ДНК). Разрыв водородных связей на 4-х витках спирали - очень энергоемкий процесс. Он не был обнаружен при изучении транскрипции.
 |
Показано, что РНК-полимераза переводит ДНК из В-формы в А-форму. В ней плоскости азотистых оснований не перпендикулярны оси спирали, а наклонены на 200 к перпендикуляру. Это облегчает "выворачивание" двух соседних азотистых оснований в цепи ДНК для того, чтобы напротив них встали комплементарные нуклеотиды РНК. В пользу этого говорит полная идентичность параметров А-формы ДНК и гибрида, состоящего из одной цепи ДНК и одной - РНК. "Мотором" транскрипции является энергия, высвобождающаяся при отщеплении пирофосфата от каждого рибо-НТФ. |
Ингибиторы транскрипции прокариот.
Существует множество ингибиторов транскрипции. Они действуют по разным механизмам и на разных стадиях. Большинство из них - антибиотики.
Рифампицин - ингибитор инициации.
Связывается с центром инициации holo-РНК-полимеразы E. сoli.
Стрептолидигин - ингибитор элонгации.
Связывается с центром элонгации core-РНК-полимеразы E. сoli.
4. Терминация.
Специфическая терминация бывает 
-
независимой и -
зависимой.
 |
При |
-зависимая
терминация.
 |
В терминаторе много Г-Ц пар (с тремя водородными связями),
вследствие чего РНК-полимераза замедляет ход, |
| Список рисунков |