Лекция 14. Топологии репликации
|
Лекция 14. Топологии репликации | |
| Список рисунков |
Топоизомеразы
Определение: топоизомеразы - ферменты, изменяющие топологию ДНК.
Топоизомеразы меняют число зацеплений одной цепи за другую.
Делятся на два класса:
Тип I (релаксазы) - уменьшают число зацеплений.
Тип II (гиразы) - увеличивают число зацеплений.
Гиразы вносят двуцепочечный разрыв ДНК по принципу работы рестриктаз.
 |
Определение: рестриктазы - эндонуклеазы, которые узнают определенные последовательности и делают разрезы в обеих цепях. |
После разрыва цепей гираза поворачивает концы ДНК на 360
и проявляет лигазную активность, т.е. сшивает цепи ДНК. В этом процессе используется
энергия АТФ. Результат деятельности гираз - супервитки.
Суперспирализованная ДНК напряжена. При высоком напряжении в суперспирали в некоторых местах цепи расходятся, т.к. расплавляются А-Т богатые участки.
Гиразы имеют отношение и к транскрипции, поскольку при напряжении в молекуле ДНК плавятся А-Т богатые районы промоторов, а палиндромы переходят в форму креста.
Все природные кольцевые двуцепочечные ДНК имеют отрицательную суперспирализацию. Один супервиток приходится на каждые 200 пар нуклеотидов.
У релаксаз есть только эндонуклеазная и лигазная активности, но нет АТФ-азной.
Они разрывают только одну цепь. Происходит раскручивание напряженной ДНК, после чего релаксаза сшивает концы. Релаксаза узнает определенную конформацию суперспирализованной молекулы ДНК и режет ее, сбрасывая тем самым лишнме супервитки.
Регуляция транскрипции в бактериальной клетке осуществляется не только на уровне белков репрессоров (активаторов), но и на уровне активности гираз и релаксаз.
| Список рисунков |