Лекция 14. Топология репликации
|
Лекция 14. Топология репликации | |
| Список рисунков |
Топологические проблемы репликации ДНК
SSB
Белки Альбертса, обнаруженные в 1968г., снижают
температуру плавления ДНК in vitro на 20-40
С.
Они связываются с ДНК электростатически, хотя имеют отрицательный заряд. Эти
белки содержат кластер положительно заряженных аминокислотных остатков, но общий
заряд белка отрицателен. У них повышенное сродство к одноцепочечной
ДНК. Белок не связывается с двуцепочечной ДНК, не имеющей расплавленных
участков.
Но если есть одноцепочечная ДНК, то белки легко садятся на нее, выпрямляют ее, превращая ДНК в "палку".
Белки связываются с двуцепочечной ДНК, если в ней есть нарушения вторичной структуры.
 |
Когда в ДНК образуется расплавленный участок, белок покрывает его за счет электростатических взаимодействий. При этом проявляется сродство белков друг к другу. Они покрывают ДНК сплошным слоем (стехиометрическое количество белка). |
Белки, сидящие на комплементарных цепях, не дают цепям схлопнуться, т.к. имеют мощный отрицательный заряд. Называются эти белки SSB (single strand bind).
Они не денатурируют ДНК, а лишь фиксируют одноцепочечное состояние.
Участие SSB в репликации абсолютно необходимо. Они удерживают матричные цепи ДНК в репликативной вилке в одноцепочечном состоянии, а также защищают одноцепочечную ДНК от действия нуклеаз. Они избирательно стимулируют работу ДНК-полимеразы. РНК-полимераза не может использовать одноцепочечную ДНК, покрытую SSB. Избирательность касается и вида. Например, SSB фага Т4 стимулирует ДНК- полимеразу фага Т4, но не ДНК-полимеразы Е. сoli.
SSB не ферменты - они нужны в стехиометрическом количестве.
| Список рисунков |